Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NEFMP07197 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NEFMP07197 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms