Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
NIPSNAP2O75323 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
NIPSNAP2O75323 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms