Protein–RNA interactions for Protein: O00559

EBAG9, Receptor-binding cancer antigen expressed on SiSo cells, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EBAG9O00559 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PTPRF-201ENST00000359947 7727 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EBAG9O00559 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SEPT7-201ENST00000350320 4350 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 DLGAP2-215ENST00000637795 3380 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EBAG9O00559 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms