Protein–RNA interactions for Protein: O00507

USP9Y, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-Y, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YO00507 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC010319.3-201ENST00000597028 470 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC006449.3-201ENST00000620144 563 ntTSL 4 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
USP9YO00507 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AL354740.1-203ENST00000593917 424 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
USP9YO00507 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
USP9YO00507 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
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