Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
LINC01387J3KSC0 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms