Protein–RNA interactions for Protein: H3BPF8

GOLGA8S, Golgin A8 family member S, humanhuman

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA8SH3BPF8 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GOLGA8SH3BPF8 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms