Protein–RNA interactions for Protein: C9JPN9

USP17L12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L12C9JPN9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
USP17L12C9JPN9 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
USP17L12C9JPN9 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms