Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC40A1-201ENST00000261024 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TRIM46-210ENST00000545012 2979 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NRG2-209ENST00000541337 3723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NOTOA8MTQ0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms