Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
SOBPA7XYQ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
SOBPA7XYQ1 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
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