Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ARID3CA6NKF2 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms