Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF316A6NFI3 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF316A6NFI3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms