Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
E2F8A0AVK6 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms