Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4D8

HECTD4, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HECTD4, humanhuman

Predictions only

Length 3,996 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECTD4Q9Y4D8 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
HECTD4Q9Y4D8 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL583810.1-201ENST00000553344 1045 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC11.08□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 SPEG-202ENST00000396686 1086 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
HECTD4Q9Y4D8 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.4 ms