Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
HDGFL3Q9Y3E1 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
HDGFL3Q9Y3E1 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms