Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
TRIM35Q9UPQ4 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms