Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
KLHL42Q9P2K6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
KLHL42Q9P2K6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms