Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SERINC1Q9NRX5 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms