Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF8

CTPS2, CTP synthase 2, humanhuman

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Length 586 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS2Q9NRF8 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CTPS2Q9NRF8 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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