Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPB9

ACKR4, Atypical chemokine receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR4Q9NPB9 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
ACKR4Q9NPB9 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
ACKR4Q9NPB9 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.4 ms