Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PDGFDQ9GZP0 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFDQ9GZP0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PDGFDQ9GZP0 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
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