Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
TRIM55Q9BYV6 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms