Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY66

KDM5D, Lysine-specific demethylase 5D, humanhuman

Predictions only

Length 1,539 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5DQ9BY66 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 NOX4-215ENST00000534731 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
KDM5DQ9BY66 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
KDM5DQ9BY66 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms