Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW9

FANCD2, Fanconi anemia group D2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCD2Q9BXW9 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 MIOX-203ENST00000395733 1021 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
FANCD2Q9BXW9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
FANCD2Q9BXW9 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms