Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE4

HERPUD2, Homocysteine-responsive endoplasmic reticulum-resident ubiquitin-like domain member 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERPUD2Q9BSE4 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
HERPUD2Q9BSE4 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms