Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
SORCS2Q96PQ0 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
SORCS2Q96PQ0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms