Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM3

C18orf8, Uncharacterized protein C18orf8, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C18orf8Q96DM3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
C18orf8Q96DM3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms