Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
NMD3Q96D46 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms