Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
HLA-CQ95604 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 POLD4-201ENST00000312419 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
HLA-CQ95604 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms