Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TAF4BQ92750 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms