Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
HERVK_113Q902F9 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
HERVK_113Q902F9 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms