Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TRIM41Q8WV44 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LINC01205-202ENST00000497996 1493 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TRIM41Q8WV44 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms