Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVM0

CCDC50, Coiled-coil domain-containing protein 50, humanhuman

Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC50Q8IVM0 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
CCDC50Q8IVM0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
CCDC50Q8IVM0 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms