Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 PAM-206ENST00000438793 5432 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 KIF5B-201ENST00000302418 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
PLD3Q8IV08 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
PLD3Q8IV08 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms