Protein–RNA interactions for Protein: Q6VVB1

NHLRC1, E3 ubiquitin-protein ligase NHLRC1, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NHLRC1Q6VVB1 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
NHLRC1Q6VVB1 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms