Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RTL6Q6ICC9 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms