Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
TMEM236Q5W0B7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms