Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 MIR6869-201ENST00000619434 62 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
FRMPD1Q5SYB0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
FRMPD1Q5SYB0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms