Protein–RNA interactions for Protein: Q5JVF3

PCID2, PCI domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCID2Q5JVF3 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
PCID2Q5JVF3 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms