Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SDK2Q58EX2 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms