Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
RAB6CQ53S08 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms