Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NBPF8Q3BBV2 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NBPF8Q3BBV2 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms