Protein–RNA interactions for Protein: Q2WGJ6

KLHL38, Kelch-like protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL38Q2WGJ6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
KLHL38Q2WGJ6 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
KLHL38Q2WGJ6 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms