Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SGSM1Q2NKQ1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SGSM1Q2NKQ1 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms