Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GEN1Q17RS7 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GEN1Q17RS7 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GEN1Q17RS7 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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