Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
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HIST3H3Q16695 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HIST3H3Q16695 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
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HIST3H3Q16695 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HIST3H3Q16695 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
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