Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PCSK7Q16549 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PCSK7Q16549 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
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PCSK7Q16549 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
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PCSK7Q16549 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PCSK7Q16549 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
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