Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
DDB1Q16531 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
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DDB1Q16531 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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DDB1Q16531 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
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DDB1Q16531 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
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DDB1Q16531 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
DDB1Q16531 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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