Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC097634.3-201ENST00000613067 820 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC13.98□□□□□ -0.17
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ZFHX3Q15911 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPAG11A-203ENST00000351436 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
ZFHX3Q15911 SPAG11B-204ENST00000361111 534 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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