Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITSN1Q15811 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
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