Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
TAF13Q15543 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
TAF13Q15543 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms